中小型的web网站，使用express+mysql开发，应该怎么进行设计，架构？

准备会用express和mysql开发一款订餐系统，在开发除了需求需要弄明白，接下来的项目开发，架构设计，文件组织和目录结构，第三方的依赖包应<爱尬聊_百科网>该怎么样进行设计、规范和选取。
可以提供一些开源的express开源的项目，文档和教程。